WTX领航多组学融合!单细胞空间全转录组+空间多蛋白检测——绘制生命动态图谱的超级工具包

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    2025.11.20
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    WTX领航多组学融合!单细胞空间全转录组+空间多蛋白检测——绘制生命动态图谱的超级工具包



    年度旗舰级单细胞空间组学平台CosMx SMI- Whole Transcriptome Panel(WTX) 不止于单细胞空间转录组学的突破,更以全转录组覆盖(18000+基因)的无偏检测能力,重新定义生命动态图谱研究的维度。但这还不够,我们还想要空间蛋白维度的检测,全景观观测生命过程、组织微环境。

    当传统技术困于局部信号捕捉,WTX已实现从单细胞分辨率到全转录组的无缝覆盖,让组织微环境中每个细胞的表达密码都清晰可辨。但我们深知:生命是复杂的,所以我们渴望更全景的视角:将空间蛋白维度深度融合,实现对生命进程与组织微环境的多模态、全尺度观测。

    为实现这一目标,我们以“技术宅”式的极致严谨,将多元技术模块视作待选的“食材”:不满足于简单堆砌,而是历经深度适配,沉淀出开箱即用的“全栈式解决方案”——让前沿的空间转录组与空间蛋白检测技术,真正成为您探索生命图谱的趁手利器。


    1. WTX +蛋白panel同片检测

    CosMx SMI平台独有的优势在于,能够在同一张组织切片上同时完成全转录组与多重蛋白的共检测,实现真正的单细胞分辨率空间多组学同步识别。当前的SMI Protein Panel覆盖64种关键蛋白,包含免疫检查点分子(如PD-1、PD-L1、CTLA4)、T细胞活化标志物(CD69、CD25等)以及信号转导分子(pSTAT1、pAKT)等,为免疫治疗机制研究与免疫微环境表型刻画给予强有力支持。

    主要优势

    单片共检测


     只需一张切片检测,RNA与蛋白信号来源一致,避免跨切片配准误差。

    功能分子覆盖精准


    免疫相关分子为核心,特别适用于T细胞活化状态、免疫逃逸机制、肿瘤-免疫界面研究。

    数据关联自然


    同一空间区域,同一细胞,可直接关联转录表达与蛋白丰度变化,召开信号通路活性评估与细胞状态分类。


    2. WTX +PCF

    PCF(PhenoCycler-Fusion)利用多轮次成像,突破传统荧光成像通道限制,支持100种以上蛋白标志物同时检测,并可以实现单细胞分辨率的空间蛋白组谱绘制。IO60 panel是即用型一款肿瘤及免疫多重抗体组合,涵盖60个经验证的人源FFPE样本标志物,可在一次实验中全面解析肿瘤细胞、基质细胞及免疫微环境结构,为多癌种的肿瘤微环境构成与空间异质性解析给予高效标准化方案。顺利获得将SMI WTX的转录信息与IO60的蛋白图谱相结合,研究者能够从两个维度重构肿瘤及其微环境的全景观空间图谱。

    主要优势

    空间分辨率匹配


    IO60可实现与SMI相同的亚细胞级空间分辨率,确保RNA-Protein层面数据精准对齐。

    IO60 panel将肿瘤标记物覆盖全面,细胞类型解析深入


    涵盖肿瘤细胞(PanCK、SOX2、TP63、角蛋白家族)、基质细胞(Podoplanin、Caveolin、Collagen IV、E-cadherin)、髓系细胞(CD206、CD209、MPO)及NK细胞(CD57、CD107)等多种特异性标记,能够系统刻画肿瘤、免疫与基质间的复杂关系。

    高度灵活定制


    在IO60 panel基础上可根据研究目的灵活增加定制蛋白靶标,兼顾标准化与创新性


    3. WTX +DPA(GeoMx DSP)

    GeoMx DSP最新的DPA(Discovery  Proteome Atlas)panel可在单次实验中同时检测超过1200种蛋白。这是现在基于抗体的通量最高的商业化空间蛋白检测平台。DPA是专为支持生物标志物发现而设计的检测方案,涵盖多种组织类型、机制通路及研究领域,包括癌症、免疫学和神经生物学:

    • 兼容40+种人类组织

    • 涵盖120+种生物学过程

    • 包含29类功能注释(细胞凋亡、分化、DNA损伤修复、MAPK Signaling、mTOR Signaling、PI3K-Akt Signaling等)

    当DPA与WTX技术结合时,可在转录组与蛋白组两个层面实现“全局+局域”相结合的空间整合分析。

    主要优势

    极高通量


    实现从免疫、信号转导、代谢到细胞骨架等多维蛋白网络的全面覆盖。

    灵活的ROI选择


    GeoMX DSP具备精细的区域划分与定向检测能力,可针对特定细胞类型或病理区域进行深度蛋白分析

    互补信息融合


    SMI WTX给予精确的空间细胞分型,DPA补充大规模蛋白表达特征,实现“定域-定性-定量”三重融合。


    4.  WTX+深度蛋白组(LCM)

    顺利获得LCM( Laser Capture Microdissection)激光显微切割技术,可在组织水平上精准切割感兴趣的区域,并结合质谱实现全蛋白组无偏检测。当与WTX组合时,可先顺利获得转录组信息识别关键功能区域,再由LCM-MS完成深度蛋白挖掘,不受任何抗体限制。

    主要优势

    精准切割、区域特异


    依据组织形态或SMI识别的功能区域进行精确定义与切割,确保空间信息精准可控。

    无偏全蛋白组覆盖


    无需预设抗体panel,可检测所有表达蛋白,发现未知分子机制。

    机制验证利器


    SMI转录组信息引导感兴趣区域定位,LCM-MS实现蛋白深度挖掘,形成空间机制研究的闭环路。




    从转录到功能的空间整合之路

    WTX与多平台蛋白组检测技术的有机结合,我们实现了从转录到蛋白、从定位到功能、从单细胞到微环境的全面空间解析。无论是关注肿瘤异质性、免疫治疗应答,还是探索组织发育与疾病进展的动态机制,这些组合方案都能为您给予高分辨率、多维度、可拓展的空间组学整合框架,让空间生物学的研究更具系统性与深度。

    如果现有方案还是不过瘾,那一定要和我们联系,一起来定制化。



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